Posted by on 1 sierpnia 2018

Współczynniki regresji odnoszą się do logu poziomu lipoprotein Lp (a), przy czym błąd standardowy (SE) zapewnia miarę zmienności próby. W polach wskazano ilorazy szans dla choroby wieńcowej, a linie poziome wskazują 95% przedziały ufności (CI) dla allelu związanego ze zwiększonym poziomem Lp (a) lipoproteiny dla każdego z SNP. Stowarzyszenia zostały dostosowane do kraju pochodzenia. Wielkość kwadratów jest odwrotnie proporcjonalna do wariancji próbkowania, na którą wpływa częstotliwość SNP. Tak więc, nawet jeśli SNP rs4708871 ma czwarty najwyższy iloraz szans na liście, niska częstotliwość tego SNP oznacza, że błąd próbkowania jest duży (jak wskazuje duży przedział ufności), więc związek z chorobą wieńcową nie był znaczący. HumanCVD BeadChip zawiera 40 SNP z regionu LPA. Po wykluczeniu SNP dla niskiej częstotliwości wywołania lub minimalnej częstotliwości allelu, dostępnych było 27 SNP do analizy asocjacji w regionie LPA (Figura i sekcja Metody w dodatkowym dodatku).
Lp (a) lipoproteinę mierzono za pomocą jednego testu immunoturbidymetrycznego o wzmocnionej lateksie (Immuno) 16 w próbkach od osobników przypadku, które uzyskano w klinikach badawczych. Ponadto, Lp (a) lipoproteinę mierzono w losowej podgrupie pacjentów indywidualnych i osobników kontrolnych za pomocą drugiego testu immunoturbidymetrycznego wzbogaconego w lateks (Randox Laboratories) na autoanalizatorze ADVIA 1800 (Siemens).
Oceniliśmy rozmiar izoformy apolipoproteiny (a) za pomocą immunoblotu w próbkach od osób chorych i osób kontrolnych, które zostały wybrane zgodnie z genotypem LPA. W celu frakcjonowania zredukowanych białek osocza stosowano elektroforezę w żelu siarczanowym z dodecylosiarczanem i agarozą w zależności od wielkości przed immunoblottingiem z przeciwciałem specyficznym wobec apolipoproteiny (a). 17 Oznaczenie ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) z genomowym DNA jako matrycą zastosowano do określić względną liczbę powtórzeń IV typu 2 LPA w podgrupie pacjentów, dla których dostępne były dane izoformowe.18
Replikacja
Testowaliśmy replikację asocjacji w trzech niezależnych populacjach, w których wzięło udział 4846 pacjentów z chorobą wieńcową i 4594 osobami kontrolnymi. Te niezależne kohorty obejmowały rodziny trio (rodziny z probandem i dwoma rodzicami lub z probandem, rodzicem i co najmniej jednym rodzeństwem) z kohorty PROCARDIS19; osoby z niewydolnymi zawałami mięśnia sercowego i osoby z grupy kontrolnej z Międzynarodowego Badania Przeżycia Zawałowego (ISIS) w Wielkiej Brytanii20; oraz osoby chore na niewydolność zawału mięśnia sercowego i osoby z grupy kontrolnej z dwóch badań osób żyjących w regionie Sztokholmu (Program Epidemiologii Serca w Sztokholmie [SHEEP] 21 oraz Badanie czynników ryzyka tętnic wieńcowych w Sztokholmie [SCARF] 22) (szczegółowe informacje znajdują się w metodach rozdział w Dodatku Uzupełniającym).
Mierzono poziomy lipoprotein Lp (a) w osoczu w próbkach pobranych od osób z badań ISIS, SHEEP i SCARF. Genotypowanie dwóch SNP LPA (rs10455872 i rs3798220) przeprowadzono za pomocą platformy TaqMan.
Analiza statystyczna
Analizę związku kandydujących genów z chorobą wieńcową przeprowadzono po wykluczeniu SNP z niskimi wskaźnikami wywołania (<95%), bardzo niską częstością (częstość mniejszych alleli, <1%) lub niesprawnością Hardy ego-Weinberga w kontrolach (P <1,0 × 10-6) [patrz też: forskolin efekty, rehabilitacja szpitalna, borderline blog ]

Powiązane tematy z artykułem: borderline blog forskolin efekty rehabilitacja szpitalna

Posted by on 1 sierpnia 2018

Współczynniki regresji odnoszą się do logu poziomu lipoprotein Lp (a), przy czym błąd standardowy (SE) zapewnia miarę zmienności próby. W polach wskazano ilorazy szans dla choroby wieńcowej, a linie poziome wskazują 95% przedziały ufności (CI) dla allelu związanego ze zwiększonym poziomem Lp (a) lipoproteiny dla każdego z SNP. Stowarzyszenia zostały dostosowane do kraju pochodzenia. Wielkość kwadratów jest odwrotnie proporcjonalna do wariancji próbkowania, na którą wpływa częstotliwość SNP. Tak więc, nawet jeśli SNP rs4708871 ma czwarty najwyższy iloraz szans na liście, niska częstotliwość tego SNP oznacza, że błąd próbkowania jest duży (jak wskazuje duży przedział ufności), więc związek z chorobą wieńcową nie był znaczący. HumanCVD BeadChip zawiera 40 SNP z regionu LPA. Po wykluczeniu SNP dla niskiej częstotliwości wywołania lub minimalnej częstotliwości allelu, dostępnych było 27 SNP do analizy asocjacji w regionie LPA (Figura i sekcja Metody w dodatkowym dodatku).
Lp (a) lipoproteinę mierzono za pomocą jednego testu immunoturbidymetrycznego o wzmocnionej lateksie (Immuno) 16 w próbkach od osobników przypadku, które uzyskano w klinikach badawczych. Ponadto, Lp (a) lipoproteinę mierzono w losowej podgrupie pacjentów indywidualnych i osobników kontrolnych za pomocą drugiego testu immunoturbidymetrycznego wzbogaconego w lateks (Randox Laboratories) na autoanalizatorze ADVIA 1800 (Siemens).
Oceniliśmy rozmiar izoformy apolipoproteiny (a) za pomocą immunoblotu w próbkach od osób chorych i osób kontrolnych, które zostały wybrane zgodnie z genotypem LPA. W celu frakcjonowania zredukowanych białek osocza stosowano elektroforezę w żelu siarczanowym z dodecylosiarczanem i agarozą w zależności od wielkości przed immunoblottingiem z przeciwciałem specyficznym wobec apolipoproteiny (a). 17 Oznaczenie ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) z genomowym DNA jako matrycą zastosowano do określić względną liczbę powtórzeń IV typu 2 LPA w podgrupie pacjentów, dla których dostępne były dane izoformowe.18
Replikacja
Testowaliśmy replikację asocjacji w trzech niezależnych populacjach, w których wzięło udział 4846 pacjentów z chorobą wieńcową i 4594 osobami kontrolnymi. Te niezależne kohorty obejmowały rodziny trio (rodziny z probandem i dwoma rodzicami lub z probandem, rodzicem i co najmniej jednym rodzeństwem) z kohorty PROCARDIS19; osoby z niewydolnymi zawałami mięśnia sercowego i osoby z grupy kontrolnej z Międzynarodowego Badania Przeżycia Zawałowego (ISIS) w Wielkiej Brytanii20; oraz osoby chore na niewydolność zawału mięśnia sercowego i osoby z grupy kontrolnej z dwóch badań osób żyjących w regionie Sztokholmu (Program Epidemiologii Serca w Sztokholmie [SHEEP] 21 oraz Badanie czynników ryzyka tętnic wieńcowych w Sztokholmie [SCARF] 22) (szczegółowe informacje znajdują się w metodach rozdział w Dodatku Uzupełniającym).
Mierzono poziomy lipoprotein Lp (a) w osoczu w próbkach pobranych od osób z badań ISIS, SHEEP i SCARF. Genotypowanie dwóch SNP LPA (rs10455872 i rs3798220) przeprowadzono za pomocą platformy TaqMan.
Analiza statystyczna
Analizę związku kandydujących genów z chorobą wieńcową przeprowadzono po wykluczeniu SNP z niskimi wskaźnikami wywołania (<95%), bardzo niską częstością (częstość mniejszych alleli, <1%) lub niesprawnością Hardy ego-Weinberga w kontrolach (P <1,0 × 10-6) [patrz też: forskolin efekty, rehabilitacja szpitalna, borderline blog ]

Powiązane tematy z artykułem: borderline blog forskolin efekty rehabilitacja szpitalna